В 1774 году показал, что пиролюзит (природный диоксид марганца, считался разновидностью магнитного железняка является соединением неизвестного металла.
Получил глицерин действием оксидов свинца на растительные и животные жиры;
Получил из природных минералов молибденита и шеелита - соответственно оксиды молибдена ( 1778) и вольфрама ( 1781).
Открыл тетрафторид кремния ( 1771), оксид бария ( 1774), мышьяковистый водород ( 1775), ряд кислот: винную ( 1769), кремнийфтористоводневу и фтороводневу ( 1771), мышьяковой кислоты ( 1775), щавелевую ( 1776), молочную ( 1780), синильную ( 1782),лимонную ( 1784) и др..
В 1769 разработал способ производства фосфора из пепла, образующегося при обжиге костей. Обнаружил способность свижопрожареного древесного угля поглощать газы ( 1777, одновременно с Фонтана Феличе).
В работе "Химический трактат о воздухе и огне" Шееле описал получение и свойства "огненного воздуха" и отметил, что атмосферный воздух состоит из двух "видов воздух": "огненного" - кислорода и "флогистированного" - азота. Однако приоритет открытия кислорода принадлежитДжозефу Пристли (1774), потому что труд Шееле была опубликована только в 1777 году. Самая труд Карла Вильгема Шееле "Химический тракт о воздух и огонь" с 1768-1773 годах.
Осенью 1785 года Шееле заболел. 19 мая1786 года он женился на своей домохозяйке Саре Поль, а 21 мая умер. О его смерти было много выдумок. Думают что курьезная страсть Шееле пробовать на вкус все, с чем он имел дело (в те годы при описании вещества необходимо было в обязательном порядке указал ее вкус), стоило ему жизни. Его нашли мертвым на своем рабочем месте в окружении массы ядовитых реактивов, некоторые источники приписывают его смерть от синильной кислоты.